从浩罕向安集延前进的道路上，布哈拉军队举步维艰，频繁的遇袭，更是让布哈拉军开始清除军队驻地附近三十里之内的居住村落，而这也进一步加深了本地人对于布哈拉军的反抗。
到了5月底，布哈拉军终于抵达了安集延城下。但是为了保护身后通往浩罕城的交通，纳迪尔.穆罕穆德不得不将阴奉阳违的浩罕人和一部分兵力丢在了身后，包围安集延城的兵力不过只有3万人而已。
而此时联军安置在安集延城内的军队就高达一万五千人，驻扎在奥什及各处要道的部队也有将近二万人。与其说是纳迪尔.穆罕穆德包围了安集延城，倒不如说是联军将城外的空地让给了布哈拉军，预备在此地将布哈拉军拖疲拖垮，然后一口气吃掉这只有生力量。
阿尔斯兰的参谋军官为联军拟定的作战计划相当成功，纳迪尔.穆罕穆德轻率而冲动的性格，使得他将自己和自己的军队轻易的送入了险地。
虽然纳迪尔.穆罕穆德和波斯人打了多年的仗，但他确实没有遇到过，在本国的土地上，本国居民居然会去帮助入侵者反抗汗国的大军。
仅仅是这一条件的变化，就使得联军可以释放出所有的兵力，而他却要把自己将近四分之一的兵力分散在身后的交通要点上，从而让两军的力量对比发生了转变。
想要围住一座城市，起码也要三倍以上的兵力。而想要强攻一座城市，更是非五倍以上的兵力不可。这都是冷兵器时代战争中总结出来的战争规律，除了少数战争天才指挥的作战外，尚未有普通军队能够打破这一规律。
纳迪尔.穆罕穆德显然不是一个天才型的将领，而联军驻扎在城外军队的牵制，也令他无法全神贯注的攻打安集延城。
因此在安集延城外蹉跎了一个多月后，布哈拉军依然劳而无功，而这只军队的军粮和士气倒是跌到了底部。就算纳迪尔.穆罕穆德再怎么逞强，此时也知道军队无法继续支持下去了，再在安集延城下逗留不去，恐怕将会酿成第二次安集延战败。
然而纳迪尔.穆罕穆德的运气真是不够好，联军在城外的军队此时的确还不足以将士气低落的布哈拉军留下，毕竟吉尔吉斯人和叶尔羌人的装备和战斗意志还是比不上布哈拉军的。
但是，就在纳迪尔.穆罕穆德预备撤退之前，固始汗带着五千和硕特部的精锐骑兵赶到了。经过了一年多的准备，固始汗的部下们不仅获得了大量的明军装备，还得到了明军军官的重新编练组织，这使得原本战力就不错的固始汗嫡系，战斗力更是上了一层楼。
崇祯十二年正月，卫拉特诸部首领在明国大臣和喀尔喀蒙古诸王的见证下，终于完成了一部用于解决卫拉特部内部争议的法典。
和硕特汗鄂齐尔图汗终于得到了诸部首领的承认，成为了卫拉特之汗，巴图尔珲台吉成为了副汗，卫拉特诸部的内部矛盾终于算是缓和了下来，初步成为了一个地方性的政权。
驻乌鲁木齐大臣杨嗣昌的抵达，也让南疆督军樊一蘅终于可以放下北疆的事务，带着固始汗和孟乔芳前往安集延，预备经略布哈拉汗国的战事。
孟乔芳带着一个骑兵师和一个炮兵团，约3千人。而固始汗则动员了近3万人，其中一万战士，一万半游牧骑兵，还有一万妇孺组织的辎重部队。显然固始汗此次就是打算去为自己占地盘的。
四月初，这只大军从库尔勒出发，花了两个多月的时间后，固始汗率领的前锋就已经翻越了费尔干纳山，进入了费尔干纳盆地之内。
固始汗和驻守于贾拉拉巴德的吉尔吉斯人取得了联系后，便了解了当下盆地内的战局状况。他立刻意识到这是击溃布哈拉军的大好机会，而只要击溃了这只大军，一直到塔什干之前，他的部队都不会遇到什么抵抗了。
固始汗自然不会再给安集延城内的阿尔斯兰立功的机会，否则他如何能够开口要求盆地西部的浩罕地区应当归于自己。于是在联络了奥什的军队之后，固始汗强行接过了城外军队的指挥权，仰仗明军参谋部的整顿，联军的指挥权其实一直掌握在明军手中。
固始汗此时同样隶属于明军序列，加上有着樊一蘅的授权，在阿尔斯兰不在场的状况下，他很轻松的就得到了城外部队的指挥权力。
经过了部署和调整之后，固始汗以硕特部的精锐为主导，从城北向城东南打了围城的布哈拉军一个措手不及。而城内的阿尔斯兰见到城外布哈拉军陷入混乱之后，便亲自率军从城南和城东两个方向出兵，把围城的布哈拉军截为三段，于是城外的布哈拉军在这样的内外夹击下彻底失去了组织。
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